Трансляция: из РНК собрать белок

Последний шаг центральной догмы. Рибосома едет по мРНК, читает её по три буквы и нанизывает аминокислоты в цепь. Разберём код, переносчиков-тРНК и сам конвейер сборки. Перед этим полезен урок про транскрипцию.

Молекулярная биология · урок 4 кодоны · тРНК · A/P/E ⏱ ~16 мин
Рибосома и код

Читаем по три буквы

Рибосома собрана из белков и рибосомной РНК. Это важный факт: РНК не только хранит информацию, но и работает как деталь машины. Рибосома садится на мРНК и едет по ней в направлении 5′→3′, считывая тройки нуклеотидов — кодоны.

Кодон
Тройка нуклеотидов. Вариантов 4³ = 64: 61 кодирует аминокислоты, 3 — стоп-сигналы (UAA, UAG, UGA).
Старт
AUG — старт-кодон. Он же кодирует метионин, поэтому цепь начинается с метионина.
Избыточность
Аминокислот около 20, а кодонов 61 — у многих аминокислот сразу несколько кодонов. Код с запасом.
Переносчик

тРНК — челнок с двумя концами

Как кодон превращается в конкретную аминокислоту? Работу делает тРНК (транспортная РНК). У неё два рабочих конца: на одном — антикодон, который спаривается с кодоном мРНК, на другом висит «своя» аминокислота. Совпал антикодон с кодоном — значит, к этому месту цепи пришла нужная аминокислота.

мРНК: 5′ — AUG · UAU · ... — 3′
тРНК-1: антикодон UAC → несёт метионин
тРНК-2: антикодон AUA → несёт тирозин
Конвейер

Три сайта: вход, стройка, выход

У рибосомы три позиции для тРНК, и цепь растёт, пока тРНК проходят по ним слева направо.

A-сайт (вход)
Сюда садится новая тРНК с аминокислотой, чей антикодон совпал с кодоном. A — aminoacyl.
P-сайт (стройка)
Здесь между аминокислотами образуется пептидная связь и растёт цепь. P — peptidyl.
E-сайт (выход)
Отработанная тРНК уходит отсюда. E — exit.

После каждой связи рибосома сдвигается на кодон: тРНК из A попадает в P, из P в E, а A-сайт освобождается под следующую. Так шаг за шагом до стоп-кодона — тогда готовый белок отпускается.

Про- и эукариоты

Где трансляция расходится

Механизм общий, но детали различаются — и на этом строятся антибиотики.

ПризнакПрокариотыЭукариоты
Посадка рибосомыпоследовательность Шайна-Дальгарно5′-кэп
Первая аминокислотаформилметионин (fMet)метионин
Где идётвместе с транскрипцией, в цитоплазмев цитоплазме, отдельно от ядра
мРНКсразу, защиты нетедет из ядра, защищена кэпом и хвостом

Формилметионин у бактерий — ещё и сигнал для нашего иммунитета. Наши белки начинаются с обычного метионина, поэтому плавающий в тканях fMet выдаёт присутствие бактерий.

Ловушки

Где чаще всего спотыкаются

✗ «Рибосома — это чистый белок»
Она из белков и рибосомной РНК; рРНК несёт структурную и каталитическую роль.
✗ «Каждой аминокислоте — свой единственный кодон»
Код избыточен: 61 кодон на ~20 аминокислот, у многих их несколько.
✗ «Старт-кодон просто отмечает начало»
AUG ещё и кодирует метионин — с него начинается цепь.
✗ «У про- и эукариот трансляция одинаковая»
Разная посадка рибосомы (Шайна-Дальгарно против кэпа) и первая аминокислота (формилметионин против метионина).
Тренажёр рассуждений

Не угадать ответ, а построить его

Прочитай вопрос и подумай сам. Потом открывай по шагу, будто рядом преподаватель и спрашивает «а почему?».

Почему антибиотик глушит бактерию, но не наши клетки, хотя рибосомы есть у всех?
Зачем клетке рибосома?
Она собирает белок, без неё клетка не живёт.
В чём подвох?
Бактериальная рибосома по строению отличается от нашей (70S против 80S).
Что делает препарат?
Садится именно на бактериальную рибосому и ломает её трансляцию, наши не трогает.
Вывод. Избирательность по мишени — вот почему такие антибиотики безопасны для нас.
Показать следующий шаг →
Как рибосома наращивает цепь — что происходит на сайтах A, P и E?
Что в A-сайте?
Входит тРНК с новой аминокислотой, её антикодон совпал с кодоном.
Что в P-сайте?
Образуется пептидная связь, цепь удлиняется на одну аминокислоту.
Что дальше?
Рибосома сдвигается: отработанная тРНК уходит через E-сайт, A-сайт освобождается под следующую.
Вывод. Так шаг за шагом до стоп-кодона, а там готовый белок отпускается.
Показать следующий шаг →
Мини-кейс

Собери, как иммунитет чует бактерию

У пациента загрязнённая рана и лихорадка. Нейтрофилы устремляются к очагу, будто «учуяли» бактерий. Один из молекулярных сигналов — короткие пептиды, начинающиеся с формилметионина.

Почему формилметионин работает как метка «чужого»?
С чего начинают белок бактерии?
С формилметионина (fMet) — так устроена их трансляция.
А наши клетки?
Наши белки начинаются с обычного метионина, без формильной группы.
Что из этого следует?
Плавающий fMet бывает только от бактерий → иммунитет узнаёт чужого и сбегается.
Вывод. Маленькая деталь трансляции превращается в сигнал тревоги для организма.
Показать следующий шаг →
Повторение

Закрепить с интервалами

Карточки подстраиваются под тебя: «легко» отодвигает повтор дальше, «снова» возвращает скоро. Прогресс хранится в браузере.

Куда дальше

Связи с другими темами

Белок собран

Дальше — как клетка чинит поломки в ДНК

В библиотеку →