Главная/Библиотека/Регуляция генов

Регуляция генов: что включить, а что погасить

В геноме тысячи генов, но клетке в каждый момент нужна лишь часть. Она включает нужное и гасит лишнее, экономя энергию. Рулить можно на любом шаге. Разберём два ярких примера: бактериальный lac-оперон и эукариотическую упаковку ДНК.

Молекулярная биология · урок 6 оперон · хроматин · эпигенетика ⏱ ~17 мин
У бактерий

Lac-оперон: включаться, только когда нужно

У бактерий связанные гены часто собраны в оперон — кластер под одним промотором, который включается и выключается целиком. Классика — lac-оперон, набор генов для расщепления лактозы. Его придумали Жакоб и Моно и получили за это Нобелевку.

Что кодирует
Гены переработки лактозы: β-галактозидаза (режет лактозу) и пермеаза (втягивает лактозу в клетку).
Есть глюкоза
Репрессор сидит на операторе и не пускает РНК-полимеразу → гены молчат. Зачем возиться с лактозой, если есть глюкоза.
Глюкозы нет, есть лактоза
Метаболит лактозы (аллолактоза) связывает репрессор, тот меняет форму и отваливается от оператора → полимераза читает гены → лактоза расщепляется.

Главная мысль

По умолчанию оперон выключен. Клетка тратит энергию на ферменты только тогда, когда появляется субстрат, который надо переваривать. Такие гены называют индуцибельными — их «наводит» сам субстрат.

У эукариот

Плотно намотано — значит выключено

У эукариот ДНК намотана на белки-гистоны (нуклеосома — 146 пар оснований на 8 гистонах). Насколько плотно намотано, настолько ген и доступен для считывания.

открыть

Ацетилирование → активно

Фермент HAT вешает ацетильные группы на гистоны, намотка ослабевает, хроматин раскручивается. Рыхлая активная ДНК — эухроматин.

закрыть

Деацетилирование → молчит

Фермент HDAC снимает ацетильные группы, ДНК плотно скручивается. Плотная молчащая ДНК — гетерохроматин.

Подсказка для памяти: Гетерохроматин — густой и как в гибернации, спит. Эухроматин наоборот встречает считывающую машину с распахнутыми объятиями.

Замолкание генов

Метилирование — выключить надолго

Есть способ погасить ген стабильнее. Фермент метилтрансфераза вешает метильные группы на цитозин в участках, богатых цитозином и гуанином (CpG-островки). Такой ген надёжно замолкает, часто заодно с деацетилированием.

Эпигенетика и рак

Когда такие метки наследуются при делении клеток, это называют эпигенетикой — включение и выключение генов без правки самой последовательности. Метилирование помогает клеткам взрослеть и специализироваться. А вот сбои метилирования замешаны в развитии рака: скажем, случайно заглушённый ген-защитник снимает тормоз с опухоли.

Полная картина

Рулить можно на любом шаге

Оперон и хроматин — лишь два примера. На деле клетка контролирует путь от гена до белка на каждом этапе.

Упаковка ДНК
Ацетилирование гистонов и метилирование ДНК — открыть или закрыть доступ.
Транскрипция
Репрессоры и активаторы (факторы транскрипции) решают, читать ли ген.
После транскрипции
Сплайсинг, стабильность мРНК, и микроРНК — короткие некодирующие РНК, которые глушат мРНК-мишень.
После трансляции
Модификации готового белка меняют его активность.
Ловушки

Где чаще всего спотыкаются

✗ «Lac-оперон всегда включён, раз гены есть»
По умолчанию выключен: репрессор сидит на операторе. Включается только при лактозе без глюкозы.
✗ «Ацетилирование гистонов выключает гены»
Наоборот, включает: раскручивает хроматин. Выключает деацетилирование.
✗ «Метилирование и ацетилирование — про одно»
Ацетилирование гистонов открывает хроматин; метилирование ДНК на цитозине стабильно глушит ген.
✗ «Регуляция бывает только на транскрипции»
Рулить можно на любом шаге — от упаковки ДНК до готового белка.
Тренажёр рассуждений

Не угадать ответ, а построить его

Прочитай вопрос и подумай сам. Потом открывай по шагу, будто рядом преподаватель и спрашивает «а почему?».

Почему бактерия ест лактозу только тогда, когда нет глюкозы?
Где лежат гены для лактозы?
Собраны в lac-оперон под одним промотором.
Что при наличии глюкозы?
Репрессор сидит на операторе и не пускает РНК-полимеразу → гены молчат.
Что меняет лактоза?
Её метаболит снимает репрессор → полимераза читает гены → лактоза расщепляется.
Вывод. Клетка тратит энергию на ферменты только когда есть что переваривать.
Показать следующий шаг →
Как ацетилирование гистонов включает ген, а метилирование ДНК выключает?
Что делает ацетилирование?
Ослабляет намотку ДНК на гистоны → хроматин раскручивается → транскрипция идёт (эухроматин).
Что делает деацетилирование?
Уплотняет обратно → ген молчит (гетерохроматин).
Где тут метилирование?
Метки на цитозине стабильно закрывают ген, часто вместе с деацетилированием.
Вывод. Это эпигенетика — включение и выключение генов без изменения самой последовательности ДНК.
Показать следующий шаг →
Мини-кейс

Собери, что случилось с геном

В опухоли ген-защитник (супрессор) не работает, хотя его последовательность цела и без мутаций. Зато в его промоторе, в CpG-островке, навешано много метильных меток.

Почему ген молчит, если он не сломан?
Что с последовательностью?
Она в порядке — значит, дело не в мутации.
Что означают метильные метки?
Метилирование цитозина в промоторе стабильно заглушает ген.
К чему это ведёт?
Ген-защитник выключен → тормоз с опухоли снят → она растёт.
Вывод. Это эпигенетическая поломка, а не мутация. Такие гены иногда удаётся «разбудить» лекарствами.
Показать следующий шаг →
Повторение

Закрепить с интервалами

Карточки подстраиваются под тебя: «легко» отодвигает повтор дальше, «снова» возвращает скоро. Прогресс хранится в браузере.

Куда дальше

Связи с другими темами

Регуляция разобрана

Дальше — что бывает, когда код меняется: мутации

В библиотеку →